Второе открытое заседание Ученого совета ФКН. Доклады Марии Попцовой и Ирины Ломазовой

1. «Методы машинного обучения в функциональной геномике» Доклад заведующей Международной лабораторией биоинформатики Марии Попцовой. Геном представляет собой сложную систему взаимодействий функциональных элементов разных уровней организации - самой последовательности ДНК, мотивов, трехмерной структуры, элементов эпигенетического кода и кода вторичных структур ДНК. С помощью методов нейросетевого глубинного обучения стало возможным аггрегирование информации о функциональных элементах разных уровней клеточной организации — геномики, эпигеномики, протеомики, метаболомики — и других «омик», с целью предсказания функциональных элементов, для которых эксперименты либо не достигли нужного качества, либо отсутствуют. В докладе я расскажу о методах глубинного обучения, разрабатываемых в международной лаборатории биоинформатики для предсказания вторичных структур ДНК. Были разработаны модели на основе сверточных (CNN), рекуррентных (RNN), генеративно-состязательных (GAN) сетей, а также методы переноса обучения с домен