Квай-Гон Джинн, Оби-Ван Кеноби и Джа-Джа Бинкс плывут через ядро планеты Набу!

На поверхности планеты джедаи встречают местного жителя — забавного лопоухого гунгана Джа-Джа Бинкса, изгнанного своими соплеменниками за неуклюжесть. Джа-Джа отводит своих новых друзей в подводный город гунганов Ото-Гунга, где они встречаются с гунганским правителем Босс Нассом. Босс Насс отказывается выступить против высадившихся на Набу боевых дроидов, но соглашается передать джедаям подводную лодку (на местном наречии она зовётся «Бонго»), на которой они, сопровождаемые Джа-Джа, добираются до столицы планеты через её ядро. Одновременно Торговая Федерация оккупирует столицу Набу — Тид и захватывает в плен 14-летнюю королеву Падме Амидалу. Джедаи спасают Амидалу и вместе с ней улетают с Набу в надежде добраться до столицы Галактической Республики — Корусанта, всё ещё надеясь на мирное решение проблемы, при этом Квай-Гон открыто подозревает Федерацию в том, что они намерены убить королеву. Корабли Федерации наносят серьёзные повреждения кораблю Амидалы, но проведённый астродроидом R2-D2 ремонт позволяет ему спастись, однако гипердвигатель повреждён и его мощности не хватит, чтобы добраться до столицы. Тем временем Нут Ганрей сообщает обо всём Сидиусу, который решается взять дело в свои руки и посылает на поиски своего ученика Дарта Мола.